海拔为五千五百到六千米,受重重山体阻挡,使喀拉喀什河谷中的年降水量仅为二十五到三十毫米,雪线附近的降水量则达三百毫米左右,北坡降水量大于南坡,主峰形成现代高山冰川作用中心,年均温零度等温线大致沿四千米等高线通过,最高山带的年均温为零下十五到七点五度。
西段山地的北坡为山地荒漠和高寒荒漠景观,低于两千七百米的前山及中山带下部为红沙与合头草荒漠,砾石质的山地棕漠土,上部为昆仑蒿为主的草原化荒漠,下部沙土地带合头草荒漠,上部为紫花针茅、银穗羊茅占优势的山地草原,阴坡出现小片雪岭云杉林,与山地草原构成山地森林草原,在三千米的塔什库尔干宽谷中为高位沼泽化草甸,米干旱冰碛丘陵与冰水冲积扇分布着雌雄麻黄为主的灌木荒漠,谷地两侧四千米以上为以粉花蒿和垫状驼绒藜占优势的高寒荒漠,四千五百到五千五百米的高山为刺矶松、高寒棘豆高寒半灌木荒漠,海拔五千五百到六千五百米的高山下部为高寒稀疏植被,上部为寒冻风化带,六千五百米以上为高山冰雪带。
位于新藏公路与车尔臣河九个大坂山即东经七十七度到八十六度,主脉向南略呈弧形,克里雅山口和喀拉米兰山口是该段联系新疆―西藏通道,中昆仑山海拔六千米以上的山峰有八座,如乌孜塔格、慕士山、琼木孜塔格,平均海拔五千到五千五百米,北坡雪线五千一百到五千八百米,主要河流有喀拉喀什河、玉龙喀什河、克里雅河、尼雅河及安迪尔河,除和田河上源喀拉喀什河和玉龙喀什河水量较大,有利灌溉外,其他河流出山后很快没入塔克拉玛干沙漠中,山地下部为合头草、红沙半灌木荒漠,棕漠土,上部为沙生针茅、短花针茅为主的草原化荒漠,棕钙土,向上过渡为针茅、昆生葱、昆仑蒿为主的高寒荒源草原,在海拔四千五百米山地内部坡麓及岩屑坡上,垫状驼绒藜、糙点地梅组成稀疏的高寒荒漠,在海拔四千五百到五千五百米的下部为稀疏植被,上部为寒冻风化带,更高山峰则为冰雪带。
向东略呈扇形展开
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